DÖNEM 1
KOMİTE 3
BİYOKİMYA
PROTEİNLERİN GENEL ÖZELLİKLERİ
1)Organizmada en fazla bulunan makromolekül: Proteinler.
2)Primer yapı: Genetik bilgiye göre belirlenir ve her protein için spesifiktir.
3)Sekonder yapıyı oluşturan bağlar: Disülfid bağları ve Hidrojen bağları.
4)Β-tabakalarda, hidrojen bağları polipeptit omurgaya dikey yerleşimlidir.
5) α-helikste, polipeptit sarılır ve hidrojen bağları omurgaya paraleldir.
6)İkincil bir amino grubuna sahip olan tek amino asit: Prolin
7)Tersiyer yapı: Proteinin fonksiyonel karakterini belirler.
8)Tersiyer yapıyı oluşturan bağlar: Hidrojen bağları, disülfid bağları, iyonik bağ, nonpolar etkileşimler, van der waals bağları.
9)Kuarterner yapı: Primer, sekonder ve tersiyer yapıları bulunan polipeptid zincirlerinin non kovalent bağlarla bir arada tutulması.
10)Proteinler diğer moleküllerle konjiyo olabilirler: Glikoproteinler, metaloproteinler, hemoproteinler, fosfoproteinler, nükleoproteinler, lipoproteinler gibi.
11)Pozitif azot dengesi: protein sentezi > protein yıkımı.
12)Negatif azot dengesi: protein sentezi < protein yıkımı.
13)Marasmus hastalığı: Kalori yani temel olarak karbonhidrat azlığı.
14)Kwashiorkor: Protein yoksunluğu.
15)Pepsin: temel mide proteazı.
16)Tripsin: Pankreatik zimojenlerin genel aktivatörü olan enzimdir.
17)Enterokinaz (enteropeptidaz): Tripsinojeni aktive ederek tripsine çevirir.
18) Aminopeptidaz : Bir ekzopeptidaz olarak oligopeptidleri N-terminal ucundan kısaltır , serbest aa ve kısa peptid zincirleri açığa çıkar.
19)Amino asit emilimiç: Sodyum-aminoasit taşıyıcı sistemi (sekonder aktif transport) veya Gamo - Glutamil döngüsü : Glutatyon üzerinden.
20)Amino asitlerin anormal transferine bir örnek : Sistinüri.
21)Sistinüri: Sistin ve dibazik aalerin tranportundan sorumlu taşıyıcıda genetik defekt , aa taşıyıcılarının en yaygın görülen defekti.
22)Sistinüri: Sistin, lizin, ornitin, arginin geri emiliminde defekt.
23) Nötral amino asit transport defekti: Hartnup hastalığı.
24)Gama glutamil döngüsü: Amino asitlerin hücreye girmesinden gama glutamil döngüsü sorumludur. 3 tane ATP harcanıyor. Bu döngüde glutatyon bulunuyor ve glutatyon harcanmadan tekrar yerine konuyor.
25)Protein turnover yolakları: Lizozomal ve sitozolik ( ubiquitin sistemi).
26)Lizozomal yolak: ATP’den bağımsız, uzun yarı ömürlü proteinler.
27) Ubiquitin/Proteozom Sistemi: ATP bağımlı, kısa ömürlü proteinler.
28) Prolin, glutamik asit, serin ve threonine (PEST dizisi)ni fazla miktarda içeren proteinler düşük yarı
ömürlüdür.
29)Ubiquitinlenme ile ilişkili patoloji: HPV( human papilloma virüs)
30)26S proteozom: Spesifik olarak ubiquitinlenmiş proteinlerin yıkılımını sağlayan büyük bir proteaz kompleksidir.
31)Proteoliz işlemi: 20S domain.
32)Ubiquitin tanınması: 19S domain.
33)Ubiquitin yıkılmaz, tekrar salgılanarak kullanılır